Makrofagi są komórkami zaangażowanymi w zjawisko usuwania niepotrzebnych elementów komórki, które jest określane jako eferocytoza – proces pochłaniania i eliminowania komórek apoptotycznych. Rola tego procesu polega na uniknięciu stanu zapalnego po apoptozie w warunkach fizjologicznych i patologicznych (głównie infekcje bakteryjne, wirusowe i pasożytnicze). Ze względu na swoją funkcję i charakter, proces ten może być w przyszłości uważany za rodzaj endocytozy. Funkcję eferocytozy wykazano w odpowiedzi przeciwdrobnoustrojowej, zapaleniu, a także w wielu różnych chorobach.

Wśród peptydów odpornościowych – HDP (ang. Host Defence Peptides) o dużej aktywności biologicznej u zwierząt, wyróżnia się katelicydyny i defensyny. Związki te stanowią naturalne elementy odporności przeciwbakteryjnej, przeciwwirusowej, przeciwgrzybiczej i przeciwpasożytniczej, a nadto wobec tych peptydów mikroorganizmy nie wykształciły oporności, co powoduje, że są one rozważane jako alternatywne substancje dla antybiotyków. Defensyny i katelicydyny w makroorganizmach zwierząt, oddziaływują bezpośrednio na zarazki i pasożyty oraz pośrednio poprzez układ odpornościowy min.

W ostatnich latach wykazano, że dla prawidłowej reaktywności układu odpornościowego niezbędne jest istnienie tzw. „receptora funkcjonalnego” inflamasomu, który składa się z receptora NLR lub ALR tworzącego tzw. „czujnik” oraz z białka ASC (ang. apoptosis-associated speck-like protein containing C-terminal Caspase Recruitment Domain, CARD), będącego tzw. „adaptorem” oraz prokaspazy 1. Rolą inflamasomu jest aktywacja kaspazy 1, uaktywnienie procesu pyroptozy i wzmaganie reakcji odpornościowych.

Stabilnie i niezawodnie funkcjonujący układ odpornościowy stanowi podstawę zdrowia, jednak by je zapewnić, układ ten musi podlegać szeregom regulacji, prowadzonych w dużej mierze przez substancje, w tym białka o właściwościach modulacyjnych. W czasie ostatniej dekady wykazano, że konserwatywne białka koroniny i butyrofiliny, cechują się bardzo swoistym oddziaływaniem na makroorganizm, w tym odgrywają ważną rolę w układzie odpornościowym. Ekspresję tych białek zarejestrowano na makrofagach, neutrofilach, limfocytach, komórkach DC i tucznych, a ich rola polega na oddziaływaniu na te komórki.