Na przestrzeni ostatnich lat opracowano wiele prostych i skutecznych procedur transformacji roślin za pośrednictwem Agrobacterium rhizogenes. Ten glebowy patogen roślin wywołuje powstawanie korzeni włośnikowatych w miejscach zranienia tkanki. Podobnie jak A. tumefaciens jest zdolny do transferu fragmentu swojego megaplazmidu Ri do komórek roślinnych, gdzie ulega on stabilnej integracji i ekspresji. Podczas gdy indukcja transgenicznych korzeni w wyniku infekcji A. rhizogenes zachodzi w stosunkowo krótkim czasie, uzyskanie roślin transgenicznych za pośrednictwem A.

Od wielu lat rzodkiewnik pospolity (Arabidopsis thaliana) wykorzystywany jest jako roślina modelowa. Znalazł on szerokie zastosowanie w biologii molekularnej, genetyce i fizjologii roślin. Ważnym przełomem w metodologii genetycznej transformacji roślin było wykazanie w przypadku Arabidopsis thaliana możliwości uzyskania transgenicznych roślin bez konieczności stosowania kultur in vitro. Metoda transformacji in planta została opisana ponad 20 lat temu.