Szlak sygnałowy Sonic Hedgehog (SHH) odgrywa istotną rolę w powstawaniu i rozwoju wielu typów nowotworów. Jego biologiczne znaczenie nie jest do końca poznane. Teoria istnienia nowotworowych komórek macierzystych tłumaczy w jaki sposób morfogen SHH może mieć wpływ na przerzutowanie i samoodnowę komórek nowotworowych. Ponadto, odkryto silny związek między SHH a czynnikiem wzrostu śródbłonka naczyniowego VEGF, który ma zasadnicze znaczenie w waskularyzacji, a tym samym w promowaniu wzrostu guzów nowotworowych i metastazie. Wskazuje się, że konstytutywna aktywacja szlaku Sonic Hedgehog przyczynia się również do oporności nowotworów na leczenie cytostatykami. Wstępne badania wskazują, że wysoka aktywność szlaku SHH jest skorelowana ze wzrostem ekspresji transporterowych białek błonowych ABC i tym samym zmniejszoną wrażliwością komórek nowotworowych na stosowane terapeutyki.