Limfocyty T regulatorowe o fenotypie CD4+CD25+ (Treg) odgrywają istotną rolę w immunosupresji. Zaburzenia ilościowe lub jakościowe w populacji tych komórek mogą być przyczyną rozwoju chorób autoimmunizacyjnych. W powstawaniu i regulowaniu funkcji limfocytów T regulatorowych ważną rolę pełni gen Foxp3 należący do czynników transkrypcyjnych. Zarówno na poziomie mRNA, jak i białka ekspresja Foxp3 jest ograniczona do komórek CD4+CD25+. Foxp3 hamuje ekpresję genów cytokin na skutek oddziaływań z jednym z kluczowych czynników transkrypcyjnych NFAT.